セカンドラボ
開業支援

セカンドラボ
開業支援

トップノウハウ記事一覧

クリニック開業における税理士の選び方

クリニック開業における税理士の選び方

更新日:

2026/11/11

投稿者:豊田 裕史

クリニック開業における税理士の選び方

クリニックを開業し経営を続けていく上で、自院に合った税理士を選ぶことは大切です。税理士は日々の会計処理や確定申告だけでなく、資金管理や将来の事業展開に関わる相談相手にもなります。 

単に費用や知名度だけで決めてしまうと、受けられるサポート範囲やアドバイスの質に偏りが生じ、開業後の経営に影響を及ぼすケースもあります。

本記事では、クリニックにおける税理士顧問料の費用感をはじめ、サポート体制に応じた相談タイミング、選定ポイントや注意点について分かりやすく解説します。

クリニックにおける税理士顧問料の費用相場

税理士に支払う費用は、クリニックの事業形態によって金額の目安が異なり、年間の費用感は以下の通りです。主に毎月の顧問料と、年に1回発生する確定申告や決算の作業費用から構成されます。

  • 個人事業主の場合:年間 50万円〜80万円程度(月額 3万〜5万円)

  • 医療法人の場合:年間 80万円〜130万円程度(月額 5万〜8万円)

なお、実際の料金は記帳代行や給与計算業務の有無、訪問・面談の頻度、スタッフ数や売上規模などの対応範囲によって変動するため、見積もり時にどこまでの業務が含まれているかを確認することが大切です。

税理士に相談するタイミング

税理士に相談するタイミングは、税理士に「事業計画書の作成や融資のサポートまで依頼するかどうか」によって異なります。自院のサポート体制や準備状況に合わせて、適切なタイミングでアプローチを開始することが大切です。 

事業計画書の作成や融資対応から依頼する場合

事業計画書の作成や融資の対応まで税理士に依頼したい場合は、物件の候補が決まったタイミングで相談するのがおすすめです。この段階から相談を開始することで、資金計画の精度を高めて有利な条件で融資申し込みを進めることができます。なお、医薬品卸や医療機器メーカーが開業コンサルとして関わっている場合は、提携している税理士の紹介を受けるケースも多く見られます。

開業後の顧問契約のみを依頼する場合

開業コンサルタントが事業計画書を作成してくれる場合や、自力で資金調達を進めるなど、税理士に開業後の会計・確定申告(顧問契約)のみを想定している場合は、開業直前の段階で探しても問題ありません。

税理士の選ぶ際のポイント・注意点

満足できるサポートを受けるには、費用や知名度だけで選ばず、自分のクリニックに本当に合う相手かを確かめることが大切です。サービス内容だけでなく、実績や対応の速さも含めて総合的に判断しましょう。以下で、契約前に確認すべき具体的なポイントを解説します。 

医療機関の開業支援実績が豊富であるか

事務所のWebサイト等に「対応可能」と記載されていても、実際の支援実績には差があります。現在進行形でどれくらいのクリニックを顧問しているか、直近での開業サポート実績が何件あるかを事前に確認することが大切です。医療の支援経験が豊富な税理士であれば、診療科ごとの収益構造や開業時の注意点を踏まえた的確な対応が期待できます。

顧問料の安さだけで判断しない

提示される顧問料が相場より安い場合、サポート範囲が記帳代行のみに限られていたり、必要なアドバイスが得られなかったりすることがあります。表面上の費用を抑えられても、適切な税務処理が行われず結果的に負担が増えてしまっては望ましくありません。提示金額だけでなく、その料金に含まれる業務内容やサポート範囲を細かく確認して比較することが求められます。

面談の頻度や連絡の取りやすさ

開業準備期から開業直後にかけては、資金繰りの相談や届出の手続きにおいて滞りないやり取りが求められます。メールやチャットツール、オンライン面談などが利用できるか、問い合わせへの返信が早いかを確認しておくと安心です。

知人ドクターからの紹介を鵜呑みにしない

先輩医師や知人からの紹介は安心感がある一方で、慎重な検討が必要です。診療科目によって必要な設備投資額や収益構造は異なるため、他院で評価が高かった税理士であっても自院の診療科に適しているとは限りません。紹介であっても事前に面談を行い、自院の方針や費用感に合っているかを自身の目で確かめることが推奨されます。

将来的な医療法人化や経営アドバイスに対応できるか

開業後に経営が軌道に乗った際、選択肢となるのが医療法人の設立です。個人事業主から医療法人へ移行するタイミングや、税制上の違いについてアドバイスできる税理士を選ぶことが望ましいと言えます。日々の会計処理にとどまらず、患者数の動向や収益状況を踏まえた助言を行えるパートナーであれば、開業後も継続的なサポートを受けられます。

まとめ

クリニックの税理士を選ぶときは、単に会計や確定申告を頼むだけでなく、経営を安心して続けていくためのパートナーを探す意識が重要です。まずは自院に必要なサポート範囲や費用の相場を把握した上で、納得のいく条件で依頼できるかを確認しましょう。

価格の安さや知人からの紹介だけで決めず、契約前に面談を行って、医療分野の実績や相談のしやすさをしっかりと確かめることが欠かせません。自院の方針に合った信頼できる税理士を見つけて、診療に集中できる環境を整えていきましょう。

医師のためのクリニック開業相談

スケジュール作成から物件探し、採用までを幅広くサポート!必要な工程だけスポットでのご相談も可能です。

無料で相談する

候補エリアの診療圏レポート

無料プレゼント

依頼する

その他開業ノウハウ

クリニック開業における居抜き物件のメリット・デメリット

クリニック開業における居抜き物件のメリット・デメリットを解説。工事費や準備期間を抑えられる強みと、レイアウトの制約や設備老朽化などの注意点をバランスよく整理しました。物件選定時や内見時、担当者に確認すべきポイントも紹介します。

クリニックの不動産契約におけるフリーレントの重要性

クリニックの不動産契約におけるフリーレントの役割と注意点を解説します。内装工事中の空家賃を抑えるメリットから、共益費の扱い・違約金特約といった契約前の確認事項、貸主と条件交渉を進める際のポイントまでまとめました。

クリニック開業における内装工事の基礎知識

クリニック開業における内装工事の基礎知識を解説。坪単価の費用相場や施工期間、内装業者の選び方から相見積もり(コンペ)の進め方までわかりやすく解説。B工事や原状回復など見落としがちな契約リスクを防ぎ、納得のいく内装準備を進めるポイントをお伝えします。

クリニック開業物件におけるスケルトンと居抜きの違い 

クリニック開業物件のスケルトンと居抜きの違いを解説します。初期工事費用や開院までの期間、レイアウトの自由度といった比較ポイントから、居抜き物件を選ぶ際に注意したい既存設備の状態やB工事の確認方法までまとめました。

クリニック開業における不動産契約の注意点

クリニック開業における不動産契約の注意点や賃料・条件交渉のポイントを解説します。契約形態の違いやフリーレントの交渉、原状回復や融資特約など、契約前に確認しておきたい知識をまとめました。

クリニック開業で注意したい普通借家契約・定期借家契約の違い 

クリニックのテナント契約で重要な普通借家契約と定期借家契約の違いを解説します。更新の有無や中途解約といった基本ルールから、定期借家契約を選ぶ際の注意点、契約前に交渉したい条件のポイントまでまとめました。

無料相談受付中

クリニック開業のご相談・情報収集はこちら

先生の構想やペースに合わせて、必要なサポートをご提案いたします。
物件や条件が決まっていなくても問題ありません。

受付時間:平日 9:00〜18:00 | 相談無料